根據(jù)生態(tài)系統(tǒng)的環(huán)境性質(zhì)和形態(tài)特征來劃分，生態(tài)系統(tǒng)可分為水生態(tài)系統(tǒng)和陸地生態(tài)系統(tǒng)。前者又分為淡水水生生態(tài)系統(tǒng)和海洋生態(tài)系統(tǒng)；后者又分為森林生態(tài)系統(tǒng)、草地生態(tài)系統(tǒng)、荒漠生態(tài)系統(tǒng)、凍原生態(tài)系統(tǒng)、農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)、城市生態(tài)系統(tǒng)等。陸地生態(tài)系統(tǒng)的劃分主要根據(jù)其組成要素、植被等特點(diǎn)，水域生態(tài)系統(tǒng)則主要根據(jù)物理和地理狀況進(jìn)一步劃分。